Trung tâm y tế huyện Hà Trung được thành lập theo Quyết định số 661/QĐ-UBND ngày 10/3/2006 và  Quyết định số 1683/QĐ-UBND ngày 07/5/2019 của UBND tỉnh Thanh Hóa.
* Cơ cấu tổ chức:

I/ BAN GIÁM ĐỐC:

+ 01 Giám đốc

+ 03 Phó giám đốc

II/ CÁC KHOA/PHÒNG TRỰC THUỘC:

1. Phòng Hành chính tổng hợp

2. Phòng truyền thông giáo dục sức khỏe

3. Phòng khám đa khoa

4. Khoa Kiểm soát bệnh tật và HIV/AIDS

5. Khoa Chăm sóc sức khỏe sinh sản

6. Khoa Cận lâm sàng

7. Khoa An toàn vệ sinh thực phẩm - Y tế công cộng và dinh dưỡng

8. Cơ sở điều trị Methadone

II/ CÁC TRẠM Y TẾ TRỰC THUỘC: